پس از تصویب شورای علمی کنگره بین المللی اندیشه های قرآنی امام خامنه ای ^{دام ظله}  در حوزه سیاست و حکمرانی،  با تدبیر رئیس پژوهشگاه علوم اسلامی  امام صادق ^{علیه السلام}  ماموریت های دبیرخانه علمی با ایجاد کمیته علمی آغازگردید و با تهیه روش جاری ، برنامه های تخصصی کنگره، تعریف و تصویب  و در مسیر انجام قرار گرفت.